新世末期(5〜1万年前)の一時期には海水が増加して、前述の通り現在の陸地は沈降海岸の形態となり、古鳥取湾とも呼ばれる大湾入がつくられました。当時は沖積層の堆積もなかったので平野もできておらず、湾入はかなりの深さがあったのではないかと考えられています。湾奥附近には現在鳥取平野に散在する面影山や大呂山、また砂丘の一ツ山・二ツ山・馬ノ背・伴山、賀露町背後の岩山、さらにスクモ山など湾の外側にある島々により、湾内には小さな島が多く点在していたと考えられます。中国の山地と新しい火山に降り注ぐ雨が洪水となって、侵食を激しくおこない、花崗岩・安山岩の山を削って礫・砂・土を大量に日本海に放出しました。大礫は陸地にとどまり、小轢は湾奥附近に、砂は湾口から湾外に厚く堆積し、泥土は濁水となって遠く沖合に運び去られたことにより、海岸部には泥を含まない美しい砂が堆積しました。砂丘を形成する海底砂はこの頃から存在していたものと考えられています。
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